Para llevar a cabo las tareas de coordinación y seguimiento de todas las actuaciones comprendidas en el Plan y abordadas por las distintas administraciones, se creó la Fundación Doñana 21. También tiene la responsabilidad de ser el interlocutor con la Unión Europea.

Como tareas específicas ha tenido:

• Organizar campañas de sensibilización, difusión y divulgación destinadas a transmitir las acciones contempladas en el Plan, así como su ejecución y desarrollo entre la población local, agentes sociales y económicos y las diferentes administraciones.
• Coordinación del desarrollo del Plan y su seguimiento.
• Organización de encuentros de intercambios de experiencias, que han servido como foro permanente de discusión e información sobre el desarrollo de las medidas en materia de turismo, agricultura, formación, comunicación, etc. En este sentido también se han organizado diferentes encuentros de expertos para verificar e intercambiar experiencias sobre el desarrollo del Plan y contrastar otras experiencias relacionadas con el desarrollo sostenible.

Actualmente se está desarrollando el plan subregional de Ordenación del Territorio de Doñana, así como el Plan Especial de Matalascañas.