La Fundación Doñana 21 está formada por un cualificado equipo de profesionales que la impulsa a través de los distintos proyectos asumidos, y que tienen como objetivo prioritario dinamizar Planes de Desarrollo Sostenible en la Comarca de Doñana. Para el cumplimiento de sus fines, para posibilitar la participación y establecer claramente las funciones de cada uno de estos profesionales, la Fundación Doñana 21 se compone de las siguientes áreas y departamentos: